盡管國內玉米和國際市場價差拉大使得全關稅進口玉米的吸引力加大，但是分析師指出配額外進口存在很大風險，主要因為國內玉米庫存龐大，國儲玉米拍賣可能導致國內外價差縮小，而且轉基因問題存在不確定性。
雖然政府目前沒有限制玉米進口，但是企業仍然對政策可能調整感到憂心忡忡。
上海匯易董事長李強表示，中國玉米庫存非常龐大，他相信中國將會加強對配額外進口的管理。
中國的國儲玉米庫存達到創紀錄的1.5億噸，可以滿足超過8個月的消費需求。
中國政府正在采取措施來減少庫存壓力，但是國儲玉米拍賣的反響平平，因此政府可能降低拍賣價格，這可能導致國內玉米價格承壓下行，進而導致玉米進口的利潤受損。
一家大型私營飼料加工公司的采購經理稱，基于上述考慮，配額外進口仍然存在很高的風險。此外，如果進口玉米中含有中國政府尚未批準的轉基因成分或其他污染成分，一旦中國政府實施新的檢查，也會給進口商帶來風險。
2014年中國的玉米進口量降至260萬噸，比2013年減少約20%，因為政府嚴查未經批準的MIR162轉基因玉米進口，導致超過100萬噸的美國玉米船貨被退運。去年底中國政府批準進口MIR162轉基因玉米，但是大多數買家仍然避開進口美國玉米，而是選擇進口烏克蘭玉米或玉米替代品。
