近年來，杭錦后旗把完善良繁體系建設作為一項重點工作強力推進，連續三年實施畜禽良繁體系建設項目，在全旗初步建成了種畜禽生產供應、配種服務、良種推廣“三位一體”的畜禽良種繁育體系，進一步擴大了畜禽良種覆蓋率，為建設現代畜牧業發揮了重要作用。
一是積極落實國家良種補貼政策，扎實推進品種改良工作。大力推廣奶牛凍精冷配、豬羊人工授精等先進實用繁育技術，不斷加快品種改良步伐，目前共完成奶牛冷配3.2萬頭、年移植鮮胚和凍胚858只，其中肉羊408只，絨山羊450只。
二是對引入的種畜禽嚴格執行報批報檢和質量把關工作，不合格的種畜禽堅決不引進，以確保引種效果，2016年引進肉用種羊208只，其中正洋種畜有限公司引進黑薩福克70只，白杜泊種公羊3只，烏骨羊51只，湖羊84只；引進優質純種寒羊2250只。
三是強化規模化養殖場科學飼養管理水平，全力推行科學飼喂技術，切實發揮效益。全旗標準化奶牛小區牧場74個，萬只肉羊育肥場42個，年出欄5000-10000只的有74個，年出欄1000-5000只肉羊育肥場133個。
截至目前，全旗奶牛良種覆蓋率達到98%，肉羊良種覆蓋率達到68%，生豬良種覆蓋率達到95%。
