一、采收一般于霜降至立冬采收。以管狀花（即花心）散開2/3時為采收適期，若將全部開放的花朵采下后加工質量差。采收菊花要選晴天露水干后進行，否則容易腐爛、變質、色遜、質差。
二、加工菊花品種繁多，各地均有獨特的傳統加工方法。
1.亳菊 在花大部分盛開齊放、花瓣普遍潔白時，連莖稈割（折）下，分二、三次收完。扎成小捆，倒掛于通風干燥處晾干3至4周，不能曝曬，否則香氣差。干燥快的色白，干燥慢的為淡黃色，至花有八成干時，即可將花摘下，置熏房內用硫磺熏白。熏后再攤曬1天即可干燥。然后裝入木板箱或竹簍，內襯牛皮紙，1層菊花一層紙相間壓實貯藏。一般畝產50千克，高產達150千克。
2.滁菊 菊花采后，陰干，熏白，曬至六成干時，用竹篩將花頭篩成圓球形，再曬至全干即成。曬時切忌用手翻動，可用竹筷輕輕翻動晾曬。
3.貢菊 菊花采后，置烘房內烘焙干燥，以無煙的木炭作燃料。烘房溫度控制在40至50℃之間。烘時將貢菊攤、竹簾上，當第1輪菊花烘至九成干時，再轉為第2輪。第2輪的溫度較第1輪低，約30至40℃。當花色烘至象牙白時，即可從烘房內取出，再置通風干燥處陰至全干。此法加工菊花，清香而有甘味，花色鮮艷而又潔白，且揮發油損失甚少，較曬熏、蒸法加工質量為好。尤其是采用硫磺熏蒸，菊花被硫和硫化物污染，嚴重影響藥菊的質量和衛生。
4.杭菊 杭菊花加工采用燒柴的小灶蒸花的辦法，鐵鍋外緣直徑50多厘米，把菊花鋪放在蒸花盤內（蒸花盤用竹篾編成，周邊斜上，上緣直徑約37至39厘米），厚約3厘米，過厚不易蒸好。鍋水燒開后，放入2至3只蒸花盤，上蓋木鍋蓋。蒸花火力要猛而均勻，每蒸一次加一次熱水。鍋水不宜過多，以免水沸到蒸花盤，影響菊花質量。蒸的時間約4至4.5分鐘，過生過熟過頭成“濕腐狀”，不易曬干；蒸的時間過短，則出現生花，剛出籠時花瓣不貼伏，顏色灰白，經風一吹則成紅褐色。過久花熟都影響質量。蒸好的菊花放在竹簾上曬，菊花未干不要翻動，晚上收進室內不能壓，曬3天后翻身一次，約曬6～7天后，收起貯藏數天以后再曬1～2天，花心完全變硬即可貯藏。
二、加工菊花品種繁多，各地均有獨特的傳統加工方法。
1.亳菊 在花大部分盛開齊放、花瓣普遍潔白時，連莖稈割（折）下，分二、三次收完。扎成小捆，倒掛于通風干燥處晾干3至4周，不能曝曬，否則香氣差。干燥快的色白，干燥慢的為淡黃色，至花有八成干時，即可將花摘下，置熏房內用硫磺熏白。熏后再攤曬1天即可干燥。然后裝入木板箱或竹簍，內襯牛皮紙，1層菊花一層紙相間壓實貯藏。一般畝產50千克，高產達150千克。
2.滁菊 菊花采后，陰干，熏白，曬至六成干時，用竹篩將花頭篩成圓球形，再曬至全干即成。曬時切忌用手翻動，可用竹筷輕輕翻動晾曬。
3.貢菊 菊花采后，置烘房內烘焙干燥，以無煙的木炭作燃料。烘房溫度控制在40至50℃之間。烘時將貢菊攤、竹簾上，當第1輪菊花烘至九成干時，再轉為第2輪。第2輪的溫度較第1輪低，約30至40℃。當花色烘至象牙白時，即可從烘房內取出，再置通風干燥處陰至全干。此法加工菊花，清香而有甘味，花色鮮艷而又潔白，且揮發油損失甚少，較曬熏、蒸法加工質量為好。尤其是采用硫磺熏蒸，菊花被硫和硫化物污染，嚴重影響藥菊的質量和衛生。
4.杭菊 杭菊花加工采用燒柴的小灶蒸花的辦法，鐵鍋外緣直徑50多厘米，把菊花鋪放在蒸花盤內（蒸花盤用竹篾編成，周邊斜上，上緣直徑約37至39厘米），厚約3厘米，過厚不易蒸好。鍋水燒開后，放入2至3只蒸花盤，上蓋木鍋蓋。蒸花火力要猛而均勻，每蒸一次加一次熱水。鍋水不宜過多，以免水沸到蒸花盤，影響菊花質量。蒸的時間約4至4.5分鐘，過生過熟過頭成“濕腐狀”，不易曬干；蒸的時間過短，則出現生花，剛出籠時花瓣不貼伏，顏色灰白，經風一吹則成紅褐色。過久花熟都影響質量。蒸好的菊花放在竹簾上曬，菊花未干不要翻動，晚上收進室內不能壓，曬3天后翻身一次，約曬6～7天后，收起貯藏數天以后再曬1～2天，花心完全變硬即可貯藏。
