在收獲的雜交玉米中將霉包爛包揀出，分好、中、差堆放于篾樓或木樓上，厚度約20厘米，經常翻動，通風晾干后脫粒，也可以將帶穗雜交玉米扎編成把，吊起晾干，或投入烤房內慢烘干燥，再進行脫粒。脫粒后的雜交玉米應風揚干凈，曝曬2―3天，利用陽光的紫外線殺死附在玉米粒上的微生物，將其含水量降至安全貯藏水分14%以下（用牙一咬即成兩半，斷面平整，聲音清脆），防止雜交玉米在貯藏期間霉變。然后用50%辛硫磷或80%敵敵畏1500倍液噴灑空倉內外及周圍環境（墻和樓板等）。新制的雜交玉米貯藏容器，在放置前也要進行消毒處理，殺滅在倉縫、地縫、板縫越冬的害蟲。
