接種后，1-6天菌絲開始萌發定植，此時袋溫比室溫低1-3℃，室溫可控制在28℃，室內相對濕度控制在70％以下。 發菌7-15天，菌絲萌發生長4―5厘米，要檢查發菌是否正常。如發現雜菌，要及時搬出培養室進行處理，室溫保持在24―27℃。注意通風。 發菌16―25天，菌絲相連，把菌條抽掉，讓氧氣直接進入菌袋深處。通氧后，菌溫在12小時內迅速升高，管理要點是，打開門窗疏散菌袋，防止高溫燒壞菌絲。 發菌26―45天，這一階段是菌袋內瘤狀物形成階段，瘤狀物形成厚薄、好壞，直接影響出菇，管理要點是適當打孔增氧，翻堆散熱，嚴防高溫燒壞菌絲，溫度控制在25℃為宜。謹防30℃以上，如果30―45天沒有起瘤狀物，證明在這段時間內溫度偏高或嚴重缺氧，將會影響正常出菇。 發菌46―60天，是營養轉化高峰階段，管理方法：45天出現轉色現象，60天轉色結束，伴隨著轉色，仍有起瘤狀物的現象，同時會出現一定量的分泌色素。菌絲由白變棕，即白→棕不能出現黃色，這段時間溫度絕對不可升高，否則影響產量。如果種植較晚(秋分后)進入轉色階段，自然氣溫降得很低，為了保溫，多采取關閉門窗不通風或少通風，這樣會造成缺氧，轉色不好，影響質量。在正常條件下60天轉色后開始出菇，直到翌年3月是出優質花菇的最佳時期，若培養室保溫好，保證室內空氣新鮮，能維持正常發菌溫度，可繼續培養20天時間，這是進一步提高產量的重要途徑。80天后袋內菌皮變為褐色，發菌結束。 發菌結束后，菌袋重量下降，是因為失水造成的，因此應將菌袋上均勻地打孔3―4個，壓入水中，根據失水情況進行浸袋，一般浸24小時即可。菌絲體在標準條件下培養的時間越長，對提高產量越好，但進人轉色中后期(轉色70％-80％)不進行催蕾措施處理會影響出菇質量。
