番茄對肥料十分敏感，追肥過早過遲、過多過少、過于集中、均不利于番茄生產。所以合理施肥是番茄高產的一項重要措施，應掌握“一控、二促、三噴、四忌”的原則。
一控：番茄定植至座果前這一時期，追肥技術上應采取控制追肥，看苗追肥，若追肥過早過多過于集中，則莖粗葉大、葉色濃綠、造成植株徒長，甚至引起落花落果。所以除植株嚴重缺肥的情況下略施清水糞或生化有機液肥(500倍)外，一般都應控制追肥。
二促：番茄幼果期和采收期應重施追肥，促進生長發育，在第一花序座果以后，且果實有核桃大時，植株要分枝，幼果要膨大，又要繼續開花結果，養分消耗大，此時要迅速施用速效肥料1—2次，一般施用30%濃度的人糞尿或5%含硫復合肥浸出液，以保證植株不脫肥，促進幼果迅速膨大時，還必須不斷供給養分，才能滿足生長的需要，否則會造成后期脫肥，而影響果實發育，造成植株早衰。此時應采取勤追猛保的方法，一般在晴天每隔10天施一次40%濃度的人糞尿或5%含硫復合肥浸出液。
三噴：番茄不僅由根部從土壤中吸收營養無素，而且可以由葉子吸收礦質營養及糖，以促進果實及種子的發育。所以在果實生長期間，特別是前期連續陰雨不能進行地下追肥時，應進行2—3次葉后噴肥，可用天緣生化有機液肥500—300倍液噴施，還可用螯合態多元復合微肥500倍液噴施，以提高番茄的品質。
四忌：番茄追肥，忌用高濃度肥料，忌濕土施肥，忌中午高溫條件下施肥，忌過于集中施肥，一則易使植株徒長，二則易產生肥害，濕土施肥、引起落花、落葉和落果等生理性病害，在高濕條件下施肥，由于土壤氣溫高，植株蒸發量大，施肥后，會妨礙植株根據系正常運轉，引起植株死亡。濕大施肥和高溫條件下施，還易引起青枯病發生。施肥時間應在清晨或傍晚進行。
