常用的含氮肥料有氯化銨(含氯離子66.3%)，氯化鉀(含氯離子47.5%)。氧元素少則有益，多則有害，所以正確施用含氯化肥，對于提高化肥施用效果有重要意義。
氯在作物營養平衡中的主要作用是參與光合作用，調節植物細胞滲透壓，并影響作物對氮、磷、鉀、鈣、鎂和硅的吸收，增強作物對病蟲害的抵抗能力，調節氣孔運動。氯能促進碳水化合物的新陳代謝，加速作物莖和葉組織的發育。氯根對土壤硝化細菌有抑制作用，能延緩銨態氮向硝態氮的轉化，保持有較多量的銨離子吸附在土壤膠體上，可使銨離子較多地保存在土壤中不流失，有利于氮的保蓄。
氯離子在土壤中的轉化主要有：在酸性土壤中，氯離子與氫離子結合生成鹽酸，能增強土壤的酸度，在中性和石灰性土壤里，殘留的氯離子與鈣離子結合生成溶解度較大的氯化鈣。所以，長期單獨施用氯化銨、氯化鉀等生理酸性肥料，一方面會引起土壤變酸，使土壤有益微生物活動受影響；另一方面，肥料中副成分能與土壤鈣結合，生成氯化鈣。氯化鈣溶解度大，能隨水流失，而鈣是形成土壤結構不可缺少的元素，鈣鹽流失過多，會破壞土壤結構造成板結。
1 因作物施用含氯化肥
根據全國對主要作物的耐氯臨界值試驗，綜合產量和產品品質因素，將作物耐氯程度分為強耐氯作物、中等耐氯作物和弱耐氯作物3類。
(1)強耐氯作物 土壤氧濃度達到600-800mg/kg，相當于每公頃每季施氯量1350-1800kg時，不影響產量和品質的作物有水稻、麥類、玉米、高梁、谷子、棉花、紅麻、蘿卜、西紅柿、甜菜、茄子和果樹中的獼猴桃、香蕉、桃樹等。
(2)中等耐氯作物 土壤氯濃度300-600mg/kg，相當于每公頃每季施氯量675-1350kg時，不影響產量和品質的作物有亞麻、大豆、菜花、菠菜、蠶豆、豌豆、草莓、花生、蘋果、山楂、甘蔗等。
(3)弱耐氯作物 土壤中氯濃度<300mg/kg，相當于每公頃每季施氯量675kg時，不影響產量和品質的作物有辣椒、大白菜、馬鈴薯、萵苣、油菜、煙草、甘薯等。
強耐氯作物施用含氯化肥不影響作物的產量和品質，根據質量檢測結果，氯對水稻、小麥、玉米等作物籽粒中蛋白質和淀粉含量，對油菜、大豆的粗蛋白質和脂肪含量，對甘蔗、甜菜的含糖量以及蔬菜中維生素C和糖分含量均無不良影響。同時蔬菜中施用含氯化肥還可降低蔬菜中硝態氮含量。
2 因地區施用含氯化肥
含氯化肥應重點用在降雨量較多的地區或季節以及灌溉條件的地方。在多雨地區或季節，施用含氯化肥后氯離子可隨水淋失，因而隨肥料帶到土壤中的氯離子不會因積累而引起“氯害”。在鹽漬化土壤中，因氯離子含量較高應少用或不用含氯化肥。
3 含氯化肥應早施深施
氯離子能抑制種子萌芽，降低發芽率和出苗率。所以含氯化肥應早施、深施，以便土壤吸附，氯離子被淋失，降低作物根層受氯害。作物根系大多集中分布在10-25cm土層內，因此，含氯化肥作基肥層施、條施、穴施應在8-12cm以下。
4 含氯化肥制成復混肥施用
用含氯化肥與尿素、磷銨、重鈣或過磷酸鈣、鈣鎂磷肥、硫酸鉀、硝酸鉀等肥料加工制成復混肥，不僅可減少氯離子的危害，而且氮、磷、鉀配合施用，可起到相得益彰的效果。
氯離子的積累與年降雨量、土壤質地和種植制度關系密切，在干旱少雨地區施用含氯化肥，氯離子在土壤中積累較多，殘留量高達30%-80%；在南方多雨地區，每公頃每季施氯量300-1450kg，5年中土壤中的氯離子也無明顯增加。據研究，在降雨量為1500mm條件下，被認為是“忌氯作物”的甘蔗、甘薯、馬鈴薯，每公頃施氯量332-135kg，對產量和質量并無不良影響。
