預防霉菌中毒的根本措施是防止飼料發霉變質，對輕微發霉的飼料必須經過去霉處理后限量飼喂，對發霉嚴重的飼料，絕對禁止喂豬。
1．防霉方法 防止飼料發霉變質的關鍵是控制水分和溫度，使谷物盡快進行干燥處理，并置于干燥、低溫及通風良好處貯存。
2．去霉方法 目前尚無滿意的方法，可用堿液（1.5%氫氧化鈉或草木灰水等）處理或用清水多次浸泡，直到浸泡液清澈無色為止。但經這種方法處理的飼料，其飼喂量仍應加以限制。
此外尚有人研究用微生物降解法，應用一種黃桿菌經過12h培養后，即可迅速全部除去玉米、花生等作物中的黃曲霉毒素等。目前，正研究應用氨、甲胺、乙胺、臭氧、氯、甲醛、氫氧化鈉、氫氧化銨、次氯酸鈉、碳酸銨、磷酸三鈉等化學藥劑與高溫結合處理霉敗飼料的方法，解毒效果很好。
