臨床癥狀、病理學檢查和流行病學調查有助于本病的診斷，但確診有賴于實驗室檢查。
1．病毒分離 當病豬開始出現癥狀時盡早宰殺，無菌采集扁桃體、腦和肺，并制成懸液，接種原代PK細胞或豬甲狀腺細胞。如果細胞培養出現合胞體病變、血吸附和血凝特性，即可證明有HEV存在。否則應繼續盲傳2代才能做出結論，當發病超過2d，分離病毒就很困難。分離病毒需無菌采取剛出現癥狀的病豬的呼吸道分泌物，腦或脊髓等按常規方法處理后，接種于豬單層胎腎原代細胞或豬甲狀腺單層細胞培養。接種后12h，觀察有無融合細胞形成。如果有HEV存在，可在接種后24h至48h出現融合細胞。分離的病毒可用血凝試驗、血細胞吸附試驗、血凝抑制試驗、血細胞吸附抑制試驗、血清中和試驗、熒光抗體染色、電鏡和免疫電鏡檢查鑒定。
2．血清學試驗 豬感染HEV后第7天開始產生抗體，2-3周達到最高峰。從發病的母豬和存活同窩仔豬采取血清，做血凝抑制試驗、血細胞吸附抑制試驗、瓊脂擴散試驗、間接免疫熒光試驗及血清中和試驗也可確診oHI和SN試驗可用于豬血清中HEV抗體的檢測，兩者具有基本相同的敏感性。還可用空斑減數試驗。由于病毒的亞臨床感染非常普遍，一般要應用雙份血清做出評價，為此首份血清需在癥狀剛出現后2d內采集，經過6- 7d以后豬已顯現癥狀，此時可能已經產生高滴度抗體，難以做出比較性評價。
1．病毒分離 當病豬開始出現癥狀時盡早宰殺，無菌采集扁桃體、腦和肺，并制成懸液，接種原代PK細胞或豬甲狀腺細胞。如果細胞培養出現合胞體病變、血吸附和血凝特性，即可證明有HEV存在。否則應繼續盲傳2代才能做出結論，當發病超過2d，分離病毒就很困難。分離病毒需無菌采取剛出現癥狀的病豬的呼吸道分泌物，腦或脊髓等按常規方法處理后，接種于豬單層胎腎原代細胞或豬甲狀腺單層細胞培養。接種后12h，觀察有無融合細胞形成。如果有HEV存在，可在接種后24h至48h出現融合細胞。分離的病毒可用血凝試驗、血細胞吸附試驗、血凝抑制試驗、血細胞吸附抑制試驗、血清中和試驗、熒光抗體染色、電鏡和免疫電鏡檢查鑒定。
2．血清學試驗 豬感染HEV后第7天開始產生抗體，2-3周達到最高峰。從發病的母豬和存活同窩仔豬采取血清，做血凝抑制試驗、血細胞吸附抑制試驗、瓊脂擴散試驗、間接免疫熒光試驗及血清中和試驗也可確診oHI和SN試驗可用于豬血清中HEV抗體的檢測，兩者具有基本相同的敏感性。還可用空斑減數試驗。由于病毒的亞臨床感染非常普遍，一般要應用雙份血清做出評價，為此首份血清需在癥狀剛出現后2d內采集，經過6- 7d以后豬已顯現癥狀，此時可能已經產生高滴度抗體，難以做出比較性評價。
