近年來，冬種甜玉米已實現連片種植，但病蟲害嚴重威脅著甜玉米的生產，成為增產的一大障礙。甜玉米的冬種為部分害蟲提供了豐富的食料，甜玉米地成為害蟲主要越冬繁殖場所，同時也為部分病原物提供了有利條件，便于病害擴展蔓延。冬種甜玉米主要病蟲害有以下幾種：
地老虎 地老虎是冬種甜玉米苗期的害蟲。人工捕捉可于清晨在甜玉米斷苗的周圍或沿著殘留在洞口的被害株，將土扒開捕捉幼蟲。采用毒餌誘殺可每畝用90%敵百蟲晶體50克，用溫水溶解成250毫升藥液，與炒香的花生麩拌均勻，傍晚撒于玉米周圍。
螟蟲 危害甜玉米的螟蟲以大螟、臺灣螟為主。防治可在大喇叭口期施藥。藥劑選用3%米樂爾顆粒劑（每畝用1公斤）或98%巴丹可濕性粉劑（畝用50克）或90%敵百蟲晶體（畝用150克，用溫水溶解稀釋）混細沙點心葉撒施。
玉米蚜 玉米蚜主要在冬種甜玉米的抽雄期發生，主要危害雄花，影響授粉。蚜蟲個體小，繁殖快，因而不能輕視。防治可用吡蟲啉3000倍液或敵蚜螟1500倍液噴霧。
玉米大斑病和小斑病 大斑病和小斑病是冬種甜玉米普遍發生的兩種病害。發生嚴重時，能使葉片枯死，造成減產。兩種病害在孕穗、抽穗期易流行。低洼地，過于密植蔭蔽地、連作地往往發病重。防治措施：1.摘除植株下部黃葉、病葉，減少再次侵染的菌源，以利通風透光。2.噴灑殺菌劑。藥劑可選用25%必撲爾乳油2500倍液或50%多菌靈乳油500倍液，或65%代森鋅可濕性粉劑1000倍液。
紋枯病 紋枯病是冬種甜玉米較嚴重的一種病害。最初在地面的1～2節葉鞘發病，主要危害乳熟期的苞葉、果穗、籽粒。土壤黏重、偏施氮肥、地勢低洼及植株郁閉、不通風、透光差的地塊都易發病。防治措施：1.改進栽培管理技術。注意清溝排水。施用腐熟有機肥。氮肥施用宜早不宜遲，宜少不宜多，適當增施鉀肥，提高植株抗病能力。2.藥劑防治。可選用25%必撲爾乳油3000倍液或70%甲基托布津可濕性粉劑800倍液，或40%科達寧懸浮劑500倍液噴霧。
地老虎 地老虎是冬種甜玉米苗期的害蟲。人工捕捉可于清晨在甜玉米斷苗的周圍或沿著殘留在洞口的被害株，將土扒開捕捉幼蟲。采用毒餌誘殺可每畝用90%敵百蟲晶體50克，用溫水溶解成250毫升藥液，與炒香的花生麩拌均勻，傍晚撒于玉米周圍。
螟蟲 危害甜玉米的螟蟲以大螟、臺灣螟為主。防治可在大喇叭口期施藥。藥劑選用3%米樂爾顆粒劑（每畝用1公斤）或98%巴丹可濕性粉劑（畝用50克）或90%敵百蟲晶體（畝用150克，用溫水溶解稀釋）混細沙點心葉撒施。
玉米蚜 玉米蚜主要在冬種甜玉米的抽雄期發生，主要危害雄花，影響授粉。蚜蟲個體小，繁殖快，因而不能輕視。防治可用吡蟲啉3000倍液或敵蚜螟1500倍液噴霧。
玉米大斑病和小斑病 大斑病和小斑病是冬種甜玉米普遍發生的兩種病害。發生嚴重時，能使葉片枯死，造成減產。兩種病害在孕穗、抽穗期易流行。低洼地，過于密植蔭蔽地、連作地往往發病重。防治措施：1.摘除植株下部黃葉、病葉，減少再次侵染的菌源，以利通風透光。2.噴灑殺菌劑。藥劑可選用25%必撲爾乳油2500倍液或50%多菌靈乳油500倍液，或65%代森鋅可濕性粉劑1000倍液。
紋枯病 紋枯病是冬種甜玉米較嚴重的一種病害。最初在地面的1～2節葉鞘發病，主要危害乳熟期的苞葉、果穗、籽粒。土壤黏重、偏施氮肥、地勢低洼及植株郁閉、不通風、透光差的地塊都易發病。防治措施：1.改進栽培管理技術。注意清溝排水。施用腐熟有機肥。氮肥施用宜早不宜遲，宜少不宜多，適當增施鉀肥，提高植株抗病能力。2.藥劑防治。可選用25%必撲爾乳油3000倍液或70%甲基托布津可濕性粉劑800倍液，或40%科達寧懸浮劑500倍液噴霧。
