一、病害防治
病害就是指雞腿菇在生長發育過程中，因受其他有害微生物的侵擾或環境條件不適宜，使其不能正常進行生長發育，甚至死亡，對生產造成損失的現象。雞腿菇病主要有以下幾種：
1、褐腐病
褐腐病一般發生于菇體及培養料面的菌絲上，起初被病菌侵入的部分長出白色棉毛狀的菌絲，其表面逐漸流出暗褐色的液體，病菌進一步蔓延之后，雞腿菇菌蓋表面會產生瘤狀突起，菌柄畸形膨脹－菇體變形，變質發出腐臭味最后爛掉。
防治措施：栽培場所周圍和菇棚內的地面及四壁噴灑500倍多菌靈溶液或100倍抗菌先鋒，并噴灑菊脂農藥，防止害蟲潛入。覆土用遠離菇棚的新鮮土，在土中噴灑500倍多菌靈溶液或100倍抗菌先鋒溶液。發病時加大菇棚通風量，降低棚內濕度，將溫度降至15℃以下，在病區噴灑500多倍多菌靈。發病嚴重時，去掉原有的覆土，將病菇燒掉，所用工具進行消毒。
2、軟腐病
發生此病時，床面覆土周圍出現白色霉斑，若不及時處理，霉斑便迅速蔓延，并變成水紅色。在雞髓菇整個生長發育階段都會受到這種病害的侵染，被侵染的料面，一般不出菇，少數子實體受到浸染后，并不發生畸形，但后期病斑可接連成片，逐漸變成褐色直至腐爛。
防治措施：局部友生時噴灑500倍多菌靈溶披，降低地面和空氣濕度，患病部位撒生石灰粉。
3、雞爪菌
雞爪菌學名叫總狀炭角菌，是雞腿菇生產中常見且危害較嚴重的病原菌，可造成減產甚至絕收。
總狀炭角菌絲與雞腿菇菌絲混合在一起，其傳播方式及與雞腿菇是拌生，寄生、還是感染，是寄生性雜茁還是競爭性雜菌等問題目前學術界尚無定論，具專家分析，主要與菌種攜帶及栽培環境有關。在舂、秋季節，溫度高于20℃時，授易出現，多在二潮菇以后出現。
防治方法：①、應使純菌種，菌種培養料滅菌要徹底最好用高壓鍋滅菌。
②、脫袋覆土栽培時，要仔細檢查菌袋內菌絲生長狀況，將出現有菌絲體呈索狀，變黃的菌袋，疑為侵染總狀炭角菌的菌袋，應單獨栽培，以防止擴散傳染。
③、在氣溫較高時，應采取不脫袋，即在袋口內小覆土栽培，栽培袋較長時可在中間截成兩段，斷面朝下，上面覆士，這樣可防止雞爪菌傳染。
④、出現雞爪菌時，及時挖出菌筒和取出覆蓋的土壤，防止傳染整個菌床。
⑤、發現雞爪菌時，用雞爪菌立滅王粉劑撤在雞爪菌上，雞爪菌吸藥后會在短時間內中毒死亡。
⑥、栽培場地和覆蓋用土，在土壤中噴灑多菌靈或甲醛進行消毒。
⑦、降低柵內溫度，把棚內溫度控制在20℃以下，不會發生雞爪菌。
4、黑頭病
雞腿菇菌蓋上出現黑色斑頭，其病原菌為輪枝霉菌，是一種常見病害，造成雞腿菇質量下降，黑頭病在溫度15℃～25℃之間，濕度大時易發生，主要是通過土壤，空氣傳播。
防治方法：
①、栽培場地應選擇沒有種過雞腿菇的場地，應噴灑0.1%多菌靈或1:200～300的克霉靈，或100倍抗菌先鋒溶液對場地進行除菌。
②、覆土要選擇沒有種過雞朋菇和其它食用菌的場地內的土壤，取菜園土時，要去掉表層10cm以上土壤，取下層土壤使用，在土壤中噴灑500倍多菌靈或100倍抗菌先鋒溶被殺滅土壕中病原菌。
③、染病后，加強通風換氣，及時摘除病菇。
5、變色菇
菇體菌柄出現褐色，或菌柄全變成褐紅色，但不腐爛，生長發育正常，但會降低商品質量。主要是疆土層含水量值高，子實體上水分過重造成的。
防治方法：
①、出菇期間，不能在菇律上噴水。
②、隧道內栽培時要防止水珠渣在菇捧上，頂部有水珠時，要用無滴膜隔離。
③、子實體生長期向，覆土層以偏干為宜。
6、畸形菇
子實體菌蓋小或菌蓋下部展開，是一種生理性病害，主要是由氧氣不足，二氧化碳渡度過高而造成的。
防治方法：①、出菇期要加強通風換氣，降低二氧化碳濃度。②、出現畸形菇后，及時摘除，并改善環境條件，讓其它子實體恢復正常生長。
7、褐色鱗片菇
子實體菌蓋表面長出許多翹起的鱗片，并變成紅褐色，從而降低商品質量。是由環境濕度低，光照強造成的。
防治防法：①、出菇期間，使環境處于黑暗或弱光環境下，長出的菇體長潔白，菌蓋表面光滑，鱗片少。②、子實體生長期間，要減少通風量，防止干風直接歐向菇體，降低菇體上水分，將空氣相對濕度保持在80%～90%之間。
8、褐色石膏霉
雞腿菇覆土層上長出一層白色至褐色霉層，初期為白色，后變為褐色粉狀，從而影響子實體生長，其病原菌為褐色石膏霉，又叫絲甚孢霉，它在自然條件下生長在土壤審的有機質上，在高溫和高濕環境下極易發生。
防治方法：①、覆蓋用土，采取去掉面表土后的下層土，土壤中有機質含量少。②、栽培場地，應選擇沒種過雞腿菇、雙孢菇等食用菌的場地。③、出現該病后，噴灑0.1%的多菌靈，或2%甲醛溶液來抑制其生長。
9、子實體干枯病
子實體頂部干枯，萎縮，生長停止，主要空氣相對濕度低，干風直接吹向子實體，造成菇體頂部失水干燥生長停止，繼面出現我萎縮死亡。
防止措施：①、子實體生長期間減少通風量，防止風直接吹向子實體，保持空氣相對濕度在80～90%之間。②、出菇干枯萎縮后，及時摘除，減少通風量，在人行道和墻壁上灑水來增加濕度，讓其它雞腿菇正常生長。
二、蟲害防治方法
危害雞腿菇的害蟲主要有嗜菇癭蚊及其幼蟲（就是常說的菌蚊、菌蛆），黑腹果蠅及其幼蟲（菌蠅，菌蛆）跳蟲、螨類，線蟲、蛞蝓（鼻涕蟲）等。
防治方法：
①、菇房在使用前噴灑一次農藥，殺滅害蟲后再撒上一層石灰面。
②、發菌期間，棚內地面、墻壁、袋子上噴灑長效殺蟲劑優士。
③、覆土后，出菇前噴灑一次氯氰菊脂。
④、安裝紗窗、紗門，以防菌蚊、菌蠅飛入。
⑤、若蟲害嚴重，出完一潮茬后，可用保糧藥（磷化鋁）熏蒸或噴灑氯氰菊脂。
⑥、出菇期間，用粘蟲紙板，或滅蚊燈誘殺，或者取腐爛子實體摻人農藥，置盤中誘殺。
⑦、噴灑農藥時，不能使用敵敵畏、水胺硫磷等農藥，以免引起子實體出現農藥中毒，長成畸形菇。
