1、幼菇不分化
幼菇不分化的原因有兩方面。
(1) 棚溫偏低棚溫低不適合幼蕾發育分化。處理方法:通過提高棚溫即可解決。
(2) 藥物影響為防發病有的菇農使用大量農藥拌料，甚至發菌期間也噴灑農藥，結果使菌袋內廢氣濃重，抑制菌絲發生。處理方法:將料面劃破后，噴施6%石灰水溶液，每天兩遍，連續2～3天，靜養發菌，待再次現蕾時，即可轉入正常管理;如果使用的藥物濃度較高，則需采取石灰水浸泡菌袋的辦法予以解決。
2、幼菇長速慢
幼菇長速慢原因是棚溫過低，或所選菌株不適合當下的溫度。處理方法是提高棚溫。
(1) 安裝大棚水溫空調器溫度隨意可調，即使選用了中高溫型菌株，也可正常出菇。
(2) 安裝土暖氣注意要點是煙道一定要順暢，并要保持足量的進風，以免棚內氧氣不足。
(3) 曬棚在棚頂部拉設黑色塑膜或高密度遮陽網，卷起草苫，棚內進熱不進光，效果不錯，但是，雨雪天氣則無法增溫。有低壓爐的栽培戶，可將“小白龍”在棚內靠墻安放一圈，最后接到鍋爐上，水燒開后的蒸汽源源不斷的輸送到塑管，給菇棚加溫，效果很好。如果是中高溫型菌株，又無力升溫，則可降溫、降濕，待氣溫回升時再行出菇。
3、菌蓋毛刺
菌蓋毛刺即菌蓋上出現一些疙疙瘩瘩的菌肉組織，很是影響菇品質量，主要原因是棚溫低，或菌株不是真正的低溫型。真正的低溫菌株，如2006等菌株，即使0℃以下也不會發生毛刺等畸形菇。處理方法:增溫保溫。
4、菜花疙瘩、粗菌柄
前者是菇蕾不分化，后者是菌蓋組織不分化，主要原因是棚內二氧化碳濃度高、氧氣供應不足。處理方法:強化通風。
5、菌蓋上翹喇叭
主要原因有藥物作用、通氣不良、菌株種性退化或菌株的溫型與該時段條件不符合。處理方法:如果是基料中有化學藥物，可參考“幼菇不分化”的處理方法;通氣不良時，應在晴好天氣的中午時段進行通風;種性退化則無法可治，菌株溫型不適合該季節，可采取升高棚溫的辦法解決。
6、氣生菌絲非常旺盛
主要原因是碳氮比失調，氮元素過多。處理方法:對料面噴灑濃度為5%左右的石灰水，或者用石灰水浸泡菌袋使氮揮發，使之盡快達到可同化水平;同時加強通風，使氣生菌絲盡快倒伏，扭結現蕾。在以后的生產中，應注意調配基料營養，使之全面均衡，尤其應加入三維精素，才能避免該類現象的發生。
7、不出菇
主要原因除基料營養的不均衡和碳氮比失調以外，還有菌株的溫型不符合現階段溫度等原因。此外，基料中含有不明物質，尤其是農藥類，對菌絲產生抑制，導致不出菇。處理方法:參考上述使用石灰水溶液進行處理。
8、子實體基部長“菌毛”
子實體基部有“菌毛”發生，菇品顯得不周正，商品質量低下。“菌毛”有的是白色的菌絲因為通氣不良、濕度較高，使食用菌長出氣生菌絲;有的則是真菌性感染，前期表現為菌絲狀，一旦溫度上升，就會發展成病害，如褐腐病等即為該種表現。處理方法:清理料面后，噴灑400倍左右的百病傻溶液，降低濕度，觀察一周左右不再發展，即可轉為正常管理。
