近年來，豬場高致病性藍耳病已轉變為以隱性感染為主，免疫抑制作用的危害越來越明顯。絕大多數的豬群中都有PRRSV隱性狀態持續感染，不考慮這一點，PRRS的問題就不能從根本上解決。
自2006年夏季，隨著變異株PRRS的發生，該病迅速波及全國各地，目前HP-PRRSV已成為我國的主要流行基因亞型。早期以母豬的高流產率（個別豬群有超過50%的母豬流產）、仔豬高發病率和高死亡率（可達到100%）為特點，近年來已轉變為以隱性感染為主。在這種情況下，藍耳病的免疫抑制作用的危害性越來越明顯，副豬嗜血桿菌、鏈球菌、豬圓環病毒及病毒性腹瀉的感染率增多，偽狂犬和豬瘟的免疫效果受到抑制，給豬場管理帶來更大范圍的問題。
豬場不發病不代表沒有藍耳病毒感染
自然感染豬不能形成對PRRSV有效而持久的免疫力，同時由于PRRSV的傳染速度很快，絕大多數的豬群中有PRRSV隱性狀態持續感染，如不考慮到這一點，PRRS的問題就不能從根本上得到解決，其他防疫也會遇到難以克服的障礙。
如何識別豬群中的PRRS，可在三個不同的層面來看。第一階段，感染早期，此時感染豬會帶毒，但普通抽查不易發現。主要危害是抑制豬的免疫機能，表現為豬瘟的免疫應答水平下降、偽狂犬的免疫保護力下降等，這些現象可通過實驗室檢驗來發現。
第二階段，是免疫抑制的加劇，各種感染性疾病增多，雖然表現為其他傳染病，檢測到的是其他病原，但核心在于豬的免疫系統機能受到PRRSV的廣泛損害。
第三階段，PRRSV感染導致豬的臨床疾病，即母豬流產、仔豬和育肥豬的呼吸道疾病。需要強調的是，多數豬群所見的臨床疾病通常是多種病原混合感染造成的后果疊加，如果粗略分析，診斷為任何一種傳染病都不足為奇，但必須認識到PRRSV是才是系列疾病的始作蛹者。
