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發(fā)菌期間的雜菌污染
發(fā)菌期間常見的主要有綠色木霉、曲霉、毛霉、鏈孢霉等雜菌，一般可采取百病傻與賽百09等藥物交替噴灑菇棚的消殺辦法，發(fā)菌期間每3~7天噴灑一遍上述藥物以預防，發(fā)現污染菌袋后及時剔出發(fā)菌室進行殺滅處理。具體防治辦法可參考有關內容，不再贅述。
出菇期間的易發(fā)病害
1、斑點病
又稱褐斑病，癥狀表現為：菌蓋上分布有大小不一的黃褐色或褐色圓形斑點，嚴重時斑點下陷呈凹狀，有時菌柄上也有不同程度的橢圓形斑點，如果任其發(fā)展，15℃左右條件下，約5～7天時間，自菌柄基部表面開始，逐漸有粘性液體滲出，并向上發(fā)展至整株、整叢菇體，形成腐爛。處理措施：首先對栽培場所嚴格進行消（毒）殺（菌），一般可噴灑賽百09或蘑菇殺病靈等藥物，間隔2天左右再次用藥；其次，菌袋出菇期間，每3~7天噴灑一次賽百09溶液，注意用藥目標為墻體和作業(yè)道等空閑處，絕對不要噴到子實體上；第三，菇棚內進行噴水增濕時，一定不能噴到菌蓋上，可采取遮蓋子實體或只噴地面等處的辦法；第五，栽培場所內使用的所有工具，在已經與栽培場所進行同步消殺后，不要隨便帶出去使用，盡量作為專用工具對待；最后，由于金針菇栽培場所的相對密閉性，應在適當控制通風的基礎上，拒絕不必要的來人或參觀，尤其本地周圍相同品種的栽培戶，需要進行技術交流時，可將菌袋或子實體帶出去進行觀察、討論，以防外菌進入、交叉感染。
2、綿毛病（即棉腐病）
癥狀表現為首先從菌柄基部開始，如同柳絮或廢棉絨狀的菌絲，先是覆蓋料面，繼之順菌柄向上發(fā)展，最后將子實體包圍，受害菇體生長無力，菌蓋色澤逐漸變深、變褐，繼而變軟，失去活力，最后腐爛，發(fā)病嚴重時，整個栽培場所的墻體、地面以及菌袋上一片白色，如同進入到棉花加工車間；棉腐病發(fā)病中期以后，金針菇菌絲和子實體的代謝能力大大減弱，抗性降低，此時，其它雜菌病害很可能會乘虛而入，導致多病齊來、交叉感染。防治措施：第一，加強通風，降低濕度；第二，采去所有病菇，并同時破壞料面；第三，設法降低溫度；第四，噴施百病傻溶液予以殺滅。
干腐病（即根腐病）
主要表現為基料表面有淀粉水溶液狀的液體滲出，先是呈液滴，繼而封閉料面，量大時液體可在袋口形成積水，染病子實體先是表現半透明狀，繼之呈白糖液狀，停止生長，后逐漸變深、發(fā)褐、死亡、變干。處理措施：基料裝袋前嚴格進行水分檢查，不使過高；合理安排出菇季節(jié)，避開18℃以上溫度；普通設施內栽培時，春季應加厚覆蓋物，并在中午時分將其噴透水；加強夜間的通風，必要時應進行強制通風；將感病菌袋連同子實體一同移出棚外，采掉病菇，將菌袋浸入到消霉王或百病傻溶液中予以浸洗，置于另外的地方進行觀察，確認病菌死亡后，可再度移入菇棚；其它措施可參考斑點病的防治。
菇期的生理性病害
1、邊壁菇
菌袋中間部位出菇，第一潮菇多為叢生，嚴重時可將塑膜撐破，二潮以后則以單生為主，導致料面不能正常出菇，影響產量。處理辦法：菌袋浸泡補水；菇蕾發(fā)生量多并長大后，可將菌袋挑出，割破塑膜，任其生長。
2、麻花菇
菌柄一般較粗，程度不同的呈彎曲、扭曲，嚴重時則呈麻花狀，商品價值低下，成熟后菌柄縱向破碎，如同一束棉線，失去商品價值。處理辦法：管理過程中，盡量不移動菌袋，使其保持較穩(wěn)定的光照等；適當進行控蕾，或采取疏蕾措施。
3、祖孫菇
同株（叢）子實體中，有粗有細、有長有短，而且差異極大，儼然祖孫數代。處理辦法：一是進行搔菌處理，這是主要措施；二是現蕾后，對菇棚進行強制通風，讓溫度很低且風速較大的通風將幼蕾“吹死”，或將菌袋移出棚外，一夜即可凍死菇蕾，然后再度現蕾，即可整齊一致。此外，還可用類似疏蕾的辦法，將菌種上先期發(fā)生的幼蕾除去，或者拔掉。
4、針尖菇
菌蓋直徑小于菌柄直徑，而且呈橄欖球尖狀，商品價值大打折扣。處理辦法：加強通風即可。
