大棚蔬菜對施肥要求很高，如果施肥不當，不僅會導致土壤板結，引起蔬菜肥害，而且還會使硝酸鹽、亞硝酸鹽含量超標。而這兩種物質對人體健康有極大的危害。因此，在大棚蔬菜生產上，我們一定要慎施化肥，科學施肥。
多施有機肥，少施化肥 有機肥料養分含量齊全，肥效持久，施用后不僅能改良菜地土壤，還可為蔬菜提供多種養分。
控施化學氮肥，增施磷鉀化肥 氮肥雖然是大棚蔬菜生產中不可缺少的肥料，但也不能過量施用。而磷、鉀作為提升蔬菜品質的元素，可參與蔬菜體內的生化反應，可活化蔬菜體內60多種酶，使蔬菜抗逆性能明顯增強，因此應大量施用。另外，在大棚蔬菜生產管理上，應適當增加掀棚、開窗的次數及時間，增加光照強度，以盡量減少蔬菜體內硝酸鹽的含量。
禁止施用硝態氮 要盡量避免施用硝酸銨、硝酸鉀以及含硝態氮的復混肥，從而減少蔬菜中硝酸鹽積累。
不宜施含氯化肥 如氯化鉀、氯化銨等。因為氯離子能降低蔬菜中的淀粉含量，易使蔬菜品質變差，產量降低，而且殘留于土壤中易造成土壤脫鈣，引起板結。
限量施用硫酸鎂、硫酸銨類肥料 因為肥料中的硫酸根離子，不易被蔬菜吸收，如果留在土壤中，還會危害蔬菜生長。另外還要限量施用碳銨，因氨氣揮發，容易引起氨害。
實施測土配方平衡施肥 大力推廣蔬菜專用型復合肥料。因為專用性肥料是根據不同蔬菜的需肥特點和土壤供肥狀況而研制確定的，養分更齊全、營養更科學、配方更合理、針對性更強，施用后能顯著提高蔬菜產量和改善蔬菜品質。
選擇含有鋅、鉬、鈣、鎂等元素的新化肥這些營養元素能積極改進蔬菜品質，同樣是蔬菜生長必不可少的。
推廣使用生物肥料 建議使用生物有機復合肥料。因為生物肥料含有微生物活化菌，它是由有機肥、無機肥、菌肥、增效劑等復合而成的優質肥料，能實現各種肥料的科學配合，使其達到優勢互補，效益相互促進，是實現大棚蔬菜平衡施肥的最佳肥料品種之一。施用生物有機復合肥，可改良土壤，增加土壤肥力，給大棚蔬菜創造良好的生長環境。
限制使用激素 有些激素如赤霉素（920）、乙烯利、多效唑等，使用后雖可起到催熟、催長的作用，但易降低蔬菜品質，因此應少用激素。
