據觀察，一般野生黃鱔在體長24厘米以下時都是雌性，體長42厘米以上的黃鱔都是雄的，24-42厘米之間的黃鱔有雄的也有雌的。人工養殖的黃鱔由于營養供應充足且品種有異，而出現超乎尋常的體長，故不能依靠以上標準來作大致判定，而應以年齡來作基本判定：一般兩年齡以內的都是雌鱔，3年以上的一般都是雄鱔。雌黃鱔頭部細小，不隆起，背部是青褐色，沒有斑紋花點，有的時候能看見3條平行的褐色素斑；身體兩側從上到下顏色逐漸變淺，褐色斑點細密而且分布均勻；腹部呈淺黃或淡青色；腹部肌肉較薄，繁殖時節用手握住雌鱔，將腹部朝上，能看見肛門前面腫脹，稍微有點透明；雌鱔不善于跳躍逃逸，性情較溫和。雄的黃鱔頭部相對較大，稍微鼓起，背部一般由褐色斑點形成3條平等的帶狀紋，身體兩側沿中線分別可見1行色素帶，其余的色素斑點均勻分布；雄的黃鱔腹部呈土黃色，個體大的呈桔紅色，腹部朝上，膨脹不明顯；解剖腹腔，未成熟的精巢細長，灰白色，表面分布有色素斑點，性成熟的精巢，比原來粗大，表面有形狀不一樣的黑色素斑紋。
