應激反應是應激原和機體反應的綜合結果，其中往往是機體的內在因素占主導作用。所以，調節機體內在因素在應激的防治中起著非常重要的作用。以前，在生產和實踐中對機體內在因素的注意不夠，只單純注重外因，防治效果不是十分理想。在防治和控制應激帶來的危害時，靠單純的一種防治方法起不到最佳防治效果。目前發現，可利用中藥的毒性低、調節性強、作用范圍廣等一系列特點對應激反應進行防治。主要從以下幾方面考慮，選用適當的中草藥物進行防治。
一、調整中樞神經的興奮狀態
用安神類中藥調整中樞神經的興奮狀態。安神類藥物具有安定神志的功效，如朱砂、磁石、龍骨等，此類藥物持重性降，具有鎮安神作用，多用于心神不安、驚悸不眠、煩躁易怒。此外酸棗仁、柏子仁、遠志、合歡皮等，該類藥潤性補，具有養心血、安心神的作用，用于心肝血虛、心神失養所致的虛煩不眠、心悸怔忡、健忘等神志不寧的虛癥。另外，寒性藥，如平肝息風藥有鉤藤、羚羊角、茅香；開竅藥有牛黃、冰片，也有增強抑制狀態的作用。清熱藥中的梔子、黃苓、丹皮、赤芍，也有相同的作用。
二、降低交感腎上腺神經的興奮性
各種寒、涼藥可以程度不等地使動物的心率減慢，尿中腎上腺素排出量減少，使參與合成兒茶酚胺的多巴胺p羥化酶(DBH)活性降低，并可使尿內分泌17OHCS排出量減少，氧消耗降低，使交感腎上腺神經的興奮性降低。其代表性藥為知母。
三、提高機體免疫能力
現已發現，有些清熱藥具有良好的抗感染作用， 如抗菌和抗病毒作用，增強機體特異性和非特異性免疫的功能。生地黃、丹皮、赤芍、龍膽草能提高T淋巴細胞數，并增強其功能；黃連、黃芩、蒲公英、金銀花可促進淋巴細胞的轉化；丹皮、赤芍可增強體液免疫功能；石膏、犀角、生地、丹皮、赤芍、金銀花、野菊花、大青葉、龍膽草、夏枯草、金喬麥能增強吞噬細胞的功能；魚腥草能促進白細胞的吞噬能力，穿心蓮能增強溶菌酶的活性；青蒿能誘生干擾素。祛風濕藥中的刺五力口能促進網狀內皮系統的吞噬功能，增強其吞噬異物和抗原的能力，并提高血清中抗體的濃度。根據這些中藥的功能，可給畜禽投服適當的中藥以提高機體的免疫力，預防應激反應的發生。
四、改善局部血液循環
活血化瘀藥可改善微循環，具體有以下幾個方面的作用：首先，由于改善了血液流質學特性(濃度、黏性、凝集性和聚集性)而產生間接效果，使流動緩慢的血液流動加速；其次，改善微循環血管形態，表現為解除微血管痙攣，減輕循環內紅細胞的瘀滯和匯集，使微血管通透性降低，微血管周圍滲出減少，如川芎、丹參、蒲黃、紅花、當歸、益母草都有類似的作用。
五、保護黏膜
有些中藥具有保護粘膜的作用。地黃、黨參、丹皮、大黃等中藥給動物服用后，可起到迅速保護粘膜的作用，使刺激原無法刺激粘膜，這種作用和胃粘膜辣椒素敏感神經元有關；滑石粉具有抑制炎性分泌的作用，形成一層被膜，防止異物和細菌侵入，還能阻止有毒物質在胃腸道內的吸收，從而起到了保護作用。
六、降低炎癥的發生
中藥的抗炎作用主要有：降低毛細血管的通透性；抑制漿液滲出，促進組織的再生和傷口的愈合；減少滲出和白細胞向炎灶聚集；抑制水腫；抑制透明脂酸酶的活性，從而起到抗炎作用。清熱解毒類藥和其它中藥，如陳皮、丹皮、桃仁、三七、桔?？善鸬浇档脱装Y反應發生的作用。
