一、生態治理
環境條件適宜程度是食用菌病蟲害發生的最重要的誘導因素。根據栽培的食用菌種類的生物學特性，選擇最佳的栽培環境，并在栽培管理中采用符合生理特性的管理方法，這是病蟲害防治的最基本治理技術。選用抗病蟲性、抗逆性強的菌種，并通過適當加大播種量，可增強抗病蟲能力。
1.注意環境衛生
搞好環境衛生是有效防治多種有害生物的重要手段之一，也是其他防治技術獲得成功的基礎。做好日常清潔衛生工作，將廢棄物和污染物及時燒毀或深埋；及時清理周邊環境中的雜草、積水及各種有機殘體，避免病蟲滋生；避免使用不清潔的污水；控制栽培場地人員流動。此外，每一季栽培結束后，應徹底清理菇場。
2.科學設計栽培場
要創造有利于食用菌、不利于病蟲害發生的環境，一般把原料庫、配料廠、肥料堆積場等感染區，與菌種室、接種室、培養室、出菇棚等易染區隔離，防止材料、人員、廢料等從污染區流動到易染區。因此，培養室應與菇場、菇棚分開，以減少培養期污染。
二、物理防治
病蟲害均有各自的生理特性和生活習性，利用各種危害食用菌的菌類、蟲類的這些特性，采用物理的、非農藥的防治，也可取得滿意的治理效果。
1.配料要慎重合理
選用新鮮、無變質的原材料；配料時勿添加過多糖、糧類營養，拌料時要求偏弱堿性。嚴格滅菌操作，避免滅菌不徹底造成的批量污染。
2.完善菇場設施減少蚊蠅介入
菇場的門窗要安裝防蟲網、紗窗等，出入菇房隨手關門，防止蠅、蚊成蟲飛入產卵。
3.選擇適宜的溫濕度
選擇適宜的溫濕度能促進菌絲的生長發育。在菌絲生長期間，溫差過大或過高都不利于菌絲的生長。如鏈孢霉的特性是喜愛高溫高濕的生態環境，把栽培環境控制在濕度70%以下，溫度控制在22℃以下，鏈孢霉可迅速受到抑制，而許多食用菌絲生長又不受影響，這也是無公害治理的好方法。
4.根據某些害蟲的生理特性進行防治
利用某些蟲害的趨光性，可在夜間用燈光誘殺。利用害蟲對食物、氣味的特殊嗜好，可用某些食物拌入藥物進行誘殺。
三、生物防治
生物防治是利用某些有益生物，殺死或抑制害蟲或害菌，從而保護栽培的食用菌（或農作物）正常生長的一種防治病蟲害的方法，即所謂以蟲治蟲、以菌治蟲、以菌治菌等。
食用菌病蟲害生物防治的主要作用類型有以下三種。
1.捕食作用在自然界，有些動物或昆蟲可以以某種（些）害蟲為食料，通常將前者稱作后者的天敵。有天敵存在，就自然地壓低了害蟲的種群數量（蟲口密度），如蜘蛛捕食蚊、蠅等，蜘蛛便是蚊、蠅的天敵。對蘑菇害蟲的防治而言，雙革螨能捕食線蟲，而類寄螨與窄株螨的食性都很廣，能捕食尖眼菌蚊、癭蚊和小桿線蟲等。
2.拮抗作用 由于不同微生物間的相互制約；彼此抵抗而出現一種微生物抑制另一種微生物生長繁殖的現象，稱作拮抗作用。利用拮抗作用，可以預防和抑制多種有害菌。在食用菌生產中，選用抗霉力強的優良菌株，就是利用拮抗作用的例子。
3.占領作用 栽培實踐表明，大多數雜菌更容易侵染未接種的培養料，包括堆肥、段木、代料培養基等。但是，當食用菌菌絲體遍布料面，甚至完全“吃料”后，雜菌較難發生。因此，在菌種制作和食用菌栽培中，常采用適當加大接種量的方法，讓菌種盡快占領培養料，以達到減少污染的目的。這就是利用占領作用抑制雜菌的例子。
環境條件適宜程度是食用菌病蟲害發生的最重要的誘導因素。根據栽培的食用菌種類的生物學特性，選擇最佳的栽培環境，并在栽培管理中采用符合生理特性的管理方法，這是病蟲害防治的最基本治理技術。選用抗病蟲性、抗逆性強的菌種，并通過適當加大播種量，可增強抗病蟲能力。
1.注意環境衛生
搞好環境衛生是有效防治多種有害生物的重要手段之一，也是其他防治技術獲得成功的基礎。做好日常清潔衛生工作，將廢棄物和污染物及時燒毀或深埋；及時清理周邊環境中的雜草、積水及各種有機殘體，避免病蟲滋生；避免使用不清潔的污水；控制栽培場地人員流動。此外，每一季栽培結束后，應徹底清理菇場。
2.科學設計栽培場
要創造有利于食用菌、不利于病蟲害發生的環境，一般把原料庫、配料廠、肥料堆積場等感染區，與菌種室、接種室、培養室、出菇棚等易染區隔離，防止材料、人員、廢料等從污染區流動到易染區。因此，培養室應與菇場、菇棚分開，以減少培養期污染。
二、物理防治
病蟲害均有各自的生理特性和生活習性，利用各種危害食用菌的菌類、蟲類的這些特性，采用物理的、非農藥的防治，也可取得滿意的治理效果。
1.配料要慎重合理
選用新鮮、無變質的原材料；配料時勿添加過多糖、糧類營養，拌料時要求偏弱堿性。嚴格滅菌操作，避免滅菌不徹底造成的批量污染。
2.完善菇場設施減少蚊蠅介入
菇場的門窗要安裝防蟲網、紗窗等，出入菇房隨手關門，防止蠅、蚊成蟲飛入產卵。
3.選擇適宜的溫濕度
選擇適宜的溫濕度能促進菌絲的生長發育。在菌絲生長期間，溫差過大或過高都不利于菌絲的生長。如鏈孢霉的特性是喜愛高溫高濕的生態環境，把栽培環境控制在濕度70%以下，溫度控制在22℃以下，鏈孢霉可迅速受到抑制，而許多食用菌絲生長又不受影響，這也是無公害治理的好方法。
4.根據某些害蟲的生理特性進行防治
利用某些蟲害的趨光性，可在夜間用燈光誘殺。利用害蟲對食物、氣味的特殊嗜好，可用某些食物拌入藥物進行誘殺。
三、生物防治
生物防治是利用某些有益生物，殺死或抑制害蟲或害菌，從而保護栽培的食用菌（或農作物）正常生長的一種防治病蟲害的方法，即所謂以蟲治蟲、以菌治蟲、以菌治菌等。
食用菌病蟲害生物防治的主要作用類型有以下三種。
1.捕食作用在自然界，有些動物或昆蟲可以以某種（些）害蟲為食料，通常將前者稱作后者的天敵。有天敵存在，就自然地壓低了害蟲的種群數量（蟲口密度），如蜘蛛捕食蚊、蠅等，蜘蛛便是蚊、蠅的天敵。對蘑菇害蟲的防治而言，雙革螨能捕食線蟲，而類寄螨與窄株螨的食性都很廣，能捕食尖眼菌蚊、癭蚊和小桿線蟲等。
2.拮抗作用 由于不同微生物間的相互制約；彼此抵抗而出現一種微生物抑制另一種微生物生長繁殖的現象，稱作拮抗作用。利用拮抗作用，可以預防和抑制多種有害菌。在食用菌生產中，選用抗霉力強的優良菌株，就是利用拮抗作用的例子。
3.占領作用 栽培實踐表明，大多數雜菌更容易侵染未接種的培養料，包括堆肥、段木、代料培養基等。但是，當食用菌菌絲體遍布料面，甚至完全“吃料”后，雜菌較難發生。因此，在菌種制作和食用菌栽培中，常采用適當加大接種量的方法，讓菌種盡快占領培養料，以達到減少污染的目的。這就是利用占領作用抑制雜菌的例子。
