1.菌絲徒長
食用菌接種后營養(yǎng)生長過旺，絨毛狀菌絲生長致密，覆土后常“鉆”出地面，并形成菌被。出現這種情況與菌種特性和環(huán)境條件有關，土層含水量較少、培養(yǎng)料含氮量過高、通風不良、空氣濕度過大等都易引起菌絲徒長，產生“冒菌絲”現象。
常見的防治方法：選用優(yōu)質菌種；將板結的菌被撬松、破壞掉；覆蓋細土，增大通風量，降低空氣相對濕度；用噴重水的方法促使菌絲扭結，形成子實體；噴施生長調節(jié)劑，促使其由營養(yǎng)生長向生殖生長轉化。
2.菌絲萎縮退化
在發(fā)菌及出菇階段，有時會出現菌絲發(fā)黃、發(fā)黑、萎縮退化甚至死亡的現象。
料害 碳氮比失調、培養(yǎng)料酸化、滋生雜菌、消毒殺菌藥劑使用不當、料內殘留有害物質等均不利于菌絲的生長。對此應加強預防，搞好培養(yǎng)料的配制與發(fā)酵，并認真檢查培養(yǎng)料，測試酸堿度，找出具體原因，視不同原因與菌絲退化情況，采取不同的補救措施。若是培養(yǎng)料酸化，應噴適量石灰水調節(jié)；若因消毒劑不當引起菌絲退化，應重新調整培養(yǎng)料，進行補充接種。
濕度過大 菌絲怕濕不怕干。如果出菇期噴水過多，覆土過薄，水滲入料內，會造成菌絲萎縮，甚至死亡。發(fā)生這種情，況要注意通風散濕，并適當改變噴水方法，噴水不宜過大、過急。
高溫熱害 在高溫、悶熱且通風不良條件下，菌絲易發(fā)黃死亡。可通過加強通風、調溫控濕，使菌絲恢復生長。
菌絲活力不強 若因菌絲本身生活力差而造成菌絲細弱、萎縮的，在覆土前可噴三十烷醇、蛋白胨溶液或蘑菇健壯劑，促其恢復生長，使菌絲健壯。
3.畸形菇
薄皮菇 培養(yǎng)料過薄、養(yǎng)分不足；覆土過薄；菌絲生活力不強或菌絲徒長、板結，出菇部位高；菇房通風不良，高溫、高濕；出菇密度大，生長過快，養(yǎng)分跟不上；菌絲老化，吸收養(yǎng)分能力下降等，都會產生薄皮菇。
防治方法：前期搞好培養(yǎng)料的發(fā)酵，合理覆土，生長期加強通風，降低菇房溫度及濕度，適當追肥，補充養(yǎng)分等。
空心菇 形成原因：氣濕較高，幼菇生長迅速，土層水分不足；幼菇生長過程中氣溫先高后低，培養(yǎng)料先干后濕，培養(yǎng)料上濕下干，土層較濕，料層較干；菌蓋表面水分蒸發(fā)量大，菌柄中間缺水。
防治方法：維持菇棚合適的溫、濕度，高濕期應早、晚通風，中午關窗，避免溫度過高以及水分蒸發(fā)過快；保證空氣相對濕度不低于90%；出菇水和結菇水要噴足，避免出現外濕內干、上濕下干現象。
硬開傘 氣溫突然下降，氣溫與料溫、氣溫與土溫反差較大，細土濕度過高而菇棚溫度過低等，使菇體養(yǎng)分代謝紊亂，造成土層中的菌柄與土上的菌蓋生長不平衡而產生分裂分離，進而形成硬開傘。
防治方法：注意保溫，不讓冷風吹進菇棚，減少溫度變化，保持適當的空氣濕度和培養(yǎng)料含水量。
地雷菇 形成原因：覆土后通風過程，土層含水量過低；土層內菌絲萎縮，播種后發(fā)菌遲；氣溫偏低；料內混有泥土。
防治方法：適量噴水，保持土層合適的含水量；覆土不宜超過3厘米；不使用摻土的牛糞等。
長柄菇 產生原因是空氣相對濕度過高、通風不良、二氧化碳濃度過高；菌絲衰老、土層菌絲生長無力。
防治方法：加強通風換氣，噴施蘑菇健壯劑。
球菇 播種時種塊過大，覆土厚度不均勻，培養(yǎng)料含水量不均，幾個或幾十個子實體擁擠在一起等會導致產生球菇。防治方法：播種時把菌種撒勻；適當增加覆土厚度，均勻覆土，合理調節(jié)水分。
鐵銹斑菇 床面噴水后未及時開門通風，菇房濕度過大，子實體表面積存小水珠，時間長后會產生鐵銹色斑點。
防治方法：噴水后延長通風時間，陰濕天氣搞好通風換氣，保持空氣新鮮，挑選好的覆土材料。
鱗片菇 氣溫偏低，菇棚偏干，環(huán)境干濕度差突然加大，菌蓋容易產生鱗片。
防治方法：出菇期注意提高空氣相對濕度并保持穩(wěn)定，防止冷風突然襲擊菇棚等。
紅根菇 多是產菇前噴水過多，土層含水量過大；過量使用葡萄糖溶液；所噴石灰水、尿素溶液濃度過高；通風不良。
防治方法：產菇期土層含水量不能過高；采菇前菇床不能噴水；菇床噴石灰水或追肥時，要注意把握好濃度。
玫瑰冠菇 即菇蓋邊緣翻翹卷起，菌褶長到菌蓋表面，褶片泛紅變色，象玫瑰色雞冠。多由化學物質污染引起，如培養(yǎng)料內混入了礦物油或酚類化合物；菇房內、菇房附近噴灑了農藥，產生一定量的有害氣體，都會導致產生玫瑰色雞冠菇。
防治方法：存放油或農藥的倉庫不宜改作菇房；不用被化學物質污染的土作覆土材料；菇房內不能用煤油燈照明，用煤爐或木材爐加溫的，要加強通風換氣；培養(yǎng)料建堆時不能與礦物油或酚類物質接觸等。
食用菌接種后營養(yǎng)生長過旺，絨毛狀菌絲生長致密，覆土后常“鉆”出地面，并形成菌被。出現這種情況與菌種特性和環(huán)境條件有關，土層含水量較少、培養(yǎng)料含氮量過高、通風不良、空氣濕度過大等都易引起菌絲徒長，產生“冒菌絲”現象。
常見的防治方法：選用優(yōu)質菌種；將板結的菌被撬松、破壞掉；覆蓋細土，增大通風量，降低空氣相對濕度；用噴重水的方法促使菌絲扭結，形成子實體；噴施生長調節(jié)劑，促使其由營養(yǎng)生長向生殖生長轉化。
2.菌絲萎縮退化
在發(fā)菌及出菇階段，有時會出現菌絲發(fā)黃、發(fā)黑、萎縮退化甚至死亡的現象。
料害 碳氮比失調、培養(yǎng)料酸化、滋生雜菌、消毒殺菌藥劑使用不當、料內殘留有害物質等均不利于菌絲的生長。對此應加強預防，搞好培養(yǎng)料的配制與發(fā)酵，并認真檢查培養(yǎng)料，測試酸堿度，找出具體原因，視不同原因與菌絲退化情況，采取不同的補救措施。若是培養(yǎng)料酸化，應噴適量石灰水調節(jié)；若因消毒劑不當引起菌絲退化，應重新調整培養(yǎng)料，進行補充接種。
濕度過大 菌絲怕濕不怕干。如果出菇期噴水過多，覆土過薄，水滲入料內，會造成菌絲萎縮，甚至死亡。發(fā)生這種情，況要注意通風散濕，并適當改變噴水方法，噴水不宜過大、過急。
高溫熱害 在高溫、悶熱且通風不良條件下，菌絲易發(fā)黃死亡。可通過加強通風、調溫控濕，使菌絲恢復生長。
菌絲活力不強 若因菌絲本身生活力差而造成菌絲細弱、萎縮的，在覆土前可噴三十烷醇、蛋白胨溶液或蘑菇健壯劑，促其恢復生長，使菌絲健壯。
3.畸形菇
薄皮菇 培養(yǎng)料過薄、養(yǎng)分不足；覆土過薄；菌絲生活力不強或菌絲徒長、板結，出菇部位高；菇房通風不良，高溫、高濕；出菇密度大，生長過快，養(yǎng)分跟不上；菌絲老化，吸收養(yǎng)分能力下降等，都會產生薄皮菇。
防治方法：前期搞好培養(yǎng)料的發(fā)酵，合理覆土，生長期加強通風，降低菇房溫度及濕度，適當追肥，補充養(yǎng)分等。
空心菇 形成原因：氣濕較高，幼菇生長迅速，土層水分不足；幼菇生長過程中氣溫先高后低，培養(yǎng)料先干后濕，培養(yǎng)料上濕下干，土層較濕，料層較干；菌蓋表面水分蒸發(fā)量大，菌柄中間缺水。
防治方法：維持菇棚合適的溫、濕度，高濕期應早、晚通風，中午關窗，避免溫度過高以及水分蒸發(fā)過快；保證空氣相對濕度不低于90%；出菇水和結菇水要噴足，避免出現外濕內干、上濕下干現象。
硬開傘 氣溫突然下降，氣溫與料溫、氣溫與土溫反差較大，細土濕度過高而菇棚溫度過低等，使菇體養(yǎng)分代謝紊亂，造成土層中的菌柄與土上的菌蓋生長不平衡而產生分裂分離，進而形成硬開傘。
防治方法：注意保溫，不讓冷風吹進菇棚，減少溫度變化，保持適當的空氣濕度和培養(yǎng)料含水量。
地雷菇 形成原因：覆土后通風過程，土層含水量過低；土層內菌絲萎縮，播種后發(fā)菌遲；氣溫偏低；料內混有泥土。
防治方法：適量噴水，保持土層合適的含水量；覆土不宜超過3厘米；不使用摻土的牛糞等。
長柄菇 產生原因是空氣相對濕度過高、通風不良、二氧化碳濃度過高；菌絲衰老、土層菌絲生長無力。
防治方法：加強通風換氣，噴施蘑菇健壯劑。
球菇 播種時種塊過大，覆土厚度不均勻，培養(yǎng)料含水量不均，幾個或幾十個子實體擁擠在一起等會導致產生球菇。防治方法：播種時把菌種撒勻；適當增加覆土厚度，均勻覆土，合理調節(jié)水分。
鐵銹斑菇 床面噴水后未及時開門通風，菇房濕度過大，子實體表面積存小水珠，時間長后會產生鐵銹色斑點。
防治方法：噴水后延長通風時間，陰濕天氣搞好通風換氣，保持空氣新鮮，挑選好的覆土材料。
鱗片菇 氣溫偏低，菇棚偏干，環(huán)境干濕度差突然加大，菌蓋容易產生鱗片。
防治方法：出菇期注意提高空氣相對濕度并保持穩(wěn)定，防止冷風突然襲擊菇棚等。
紅根菇 多是產菇前噴水過多，土層含水量過大；過量使用葡萄糖溶液；所噴石灰水、尿素溶液濃度過高；通風不良。
防治方法：產菇期土層含水量不能過高；采菇前菇床不能噴水；菇床噴石灰水或追肥時，要注意把握好濃度。
玫瑰冠菇 即菇蓋邊緣翻翹卷起，菌褶長到菌蓋表面，褶片泛紅變色，象玫瑰色雞冠。多由化學物質污染引起，如培養(yǎng)料內混入了礦物油或酚類化合物；菇房內、菇房附近噴灑了農藥，產生一定量的有害氣體，都會導致產生玫瑰色雞冠菇。
防治方法：存放油或農藥的倉庫不宜改作菇房；不用被化學物質污染的土作覆土材料；菇房內不能用煤油燈照明，用煤爐或木材爐加溫的，要加強通風換氣；培養(yǎng)料建堆時不能與礦物油或酚類物質接觸等。
